Uji Aktivitas SOD (Superoxide Dismutase) Bakteri Limbah Cair Tahu dengan Metode WST-1 (Water Soluble Tetrazolium Salt-1) dan Identifikasi Molekuler Bakteri Menggunakan PCR 16S rDNA
UJI AKTIVITAS SOD (Superoxide Dismutase) BAKTERI LIMBAH CAIR TAHU DENGAN METODE WST-1 (Water Soluble Tetrazolium Salt-1) DAN IDENTIFIKASI MOLEKULER BAKTERI MENGGUNAKAN PCR 16S rDNA
Abstract
Abstrak-Superoksida dismutase (SOD) merupakan enzim antioksidan endogen yang dapat dihasilkan oleh beberapa mikroorganisme seperti bakteri yang digunakan untuk menetralisir radikal bebas. Tujuan penelitian ini adalah isolasi dan identifikasi bakteri penghasil SOD dari limbah cair tahu, menguji aktivitas SOD dan identifikasi molekuler dengan PCR 16S rDNA bakteri yang memiliki aktivitas SOD tertinggi. Tahapan penelitian meliputi: isolasi bakteri dari limbah cair tahu menggunakan media NA. Lima isolat bakteri dipilih dan diidentifikasi berdasarkan perbedaan morfologi. Tahap selanjutnya ekstraksi SOD, penetapan kadar protein dengan BCA Assay dan uji aktivitas menggunakan WST-1 Assay Kit. Bakteri dengan aktivitas SOD tertinggi didentifikasi molekuler menggunakan PCR 16S rDNA. Lima isolat bakteri berhasil diisolasi. LCT 1, 2 dan 3 termasuk Gram positif sedangkan LCT 4 dan 5 termasuk Gram negatif. Ekstraksi enzim dilakukan pada kelima isolat lalu dipresipitasi dengan amonium sulfat 80%. Isolat LCT 5 memiliki aktivitas SOD tertinggi yaitu 87,90%. Hasil identifikasi PCR 16S rDNA adalah Pseudomonas aeruginosa strain HSS-6.
Downloads
Download data is not yet available.
References
Akihary, C. V., & Kolondam, B. J. (2020). Pemanfaatan Gen 16s rRNA sebagai Perangkat Identifikasi Bakteri untuk Penelitian-Penelitian di Indonesia. Pharmacon 9(1): 16-22.
Amaliah, Z. Z. N., Bahri, S., & Amelia, P. (2018). Isolasi dan Karakterisasi Bakteri Asam Laktat dari Limbah Cair Rendaman Kacang Kedelai. Jurnal Fitofarmaka Indonesia 5(1): 253-257.
Anggraini, N. E. D., & Setiawan, N. C. E. (2018). Uji Daya Hambat Antibakteri Ekstrak Kasar Enzim Bromelin dari Bonggol Nanas Terhadap Lactobasillus acidhopilus (Ananas comosus (L) Merr) (Doctoral dissertation, Akademi Farmasi Putera Indonesia Malang).
Azhar, F. F., Elvinawati, E., & Nurhamidah, N. (2019). Perbandingan sensitivitas nanopartikel perak dengan Reduktor Albumin dari Telur Ayam dan Bebek untuk Analisis Merkuri. Alotrop, 3(2).
Brahmachari, G., Laskar, S., & Barik, P. (2013). Magnetically Separable MnFe 2 O 4 Nano-Material: An Efficient and Reusable Heterogeneous Catalyst for The Synthesis of 2-Substituted Benzimidazoles and The Extended Synthesis of Quinoxalines at Room Temperature Under Aerobic Conditions. RSC Advances 3(34): 14245-14253.
Fitriya, R. T., Ibrahim, M., & Lisdiana, L. (2015). Keefektifan metode isolasi DNA kit dan CTAB/NaCl yang dimodifikasi pada Staphylococcus aureus dan Shigelladysentriae. LenteraBio, 4(1), 87-92.
Frka‐Petesic, B., Radavidson, H., Jean, B., & Heux, L. (2017). Dynamically Controlled Iridescence of Cholesteric Cellulose Nanocrystal Suspensions Using Electric Fields. Advanced Materials 29(11): 1606208.
Hamidah, M. N., Rianingsih, L., &Romadhon, R. (2019). Aktivitas antibakteri isolat bakteri asam laktat dari peda dengan jenis ikan berbeda terhadap E. coli dan S. aureus. Jurnal Ilmu dan Teknologi Perikanan, 1(2), 11-21.
He, F. (2011). BCA (bicinchoninic acid) protein assay. Bio-protocol, e44-e44.
Indrayati, A., Yurina, V., Pitayu, L. A., & Retnoningrum, D. S. (2011). 16S rDNA-Based Identification of Novel Superoxide Dismutase Producing Bacteria Isolated from Indonesia. Microbiology Indonesia 5(2): 6-6.
Kementerian Kesehatan RI. (2020). Farmakope Indonesia. Edisi VI. Jakarta: Kementerian Kesehatan RI.
Malik, A., Fitri, N., Muna, F., Soebandrio, A., Karuniawati, A., & Sunarno, S. (2014). Metode Cepat Ekstraksi DNA Corynebacterium Diphtheriae untuk Pemeriksaan PCR. Indonesian Bulletin of Health Research 42(2): 20075.
Noer, S. (2021). Identifikasi Bakteri Secara Molekular Menggunakan 16S rRNA. EduBiologia: Biological Science and Education Journal, 1(1), 1-6.
Nofiani, R., Rizky, R., Briliantoro, R., & Ardiningsih, P. (2022). Anti-bacteria and toxicity potential of a rare Actinobacterium Pseudonocardia sp. SM1A, isolated from Mangrove Park, West Kalimantan, Indonesia. Biodiversitas Journal of Biological Diversity, 23(1).
Pananjung, A. M. S., Ulfa, E. U., Senjarini, K., & Arimurti, S. (2016). Karakterisasi isolat bakteri fibrinolitik WU 021055 asal perairan Pantai Papuma, Jember. Jurnal Bioteknologi & Biosains Indonesia (JBBI), 2(1), 1-8.
Qwele, K., Hugo, A., Oyedemi, S. O., Moyo, B., Masika, P. J., & Muchenje, V. (2013). Chemical Composition, Fatty Acid Content and Antioxidant Potential of Meat from Goats Supplemented with Moringa (Moringa oleifera) Leaves, Sunflower Cake and Grass Hay. Meat Science 93(3): 455-462.
Rachmawati, D., Monika, N. L. G. M., & Masruroh, U. (2018). Potensi abu sekam padi untuk meningkatkan ketahanan oksidatif non-enzimatik dan produksi padi merah pada cekaman kekeringan. Jurnal Agronomi Indonesia (Indonesian Journal of Agronomy), 46(1), 24-32.
Safrida, Y. D., Yulvizar, C., & Devira, C. N. (2012). Isolasi dan karakterisasi bakteri berpotensi probiotik pada ikan kembung (Rastrelliger sp.). Depik, 1(3).
Sinaga, M., Nugroho, T. T., & Dahliaty, A. (2014). Pemekatan Enzim Selulase Penicillium sp. LBKURCC20 dengan Pengendapan Amonium Sulfat 80% Jenuh (Doctoral dissertation, Riau University).
Sjafaraenan, S., Lolodatu, H., Johannes, E., Agus, R., & Sabran, A. (2018). Profil DNA Gen Follicle Stimulating Hormone Reseptor (FSHR) pada Wanita Akne dengan Teknik PCR dan Sekuensing DNA. Bioma: Jurnal Biologi Makassar 3(1): 1-11.
Sugiharto. (1994). Dasar-Dasar Pengolahan Air Limbah. Universitas Indonesia. Jakarta.
Weisburg W.G., Barns S.M., Pelletier D.A., & Lane DJ. (1991). 16S Ribosomal DNA Amplification for Phylogenetic Study. Journal of Bacteriol 173(2): 697-703.
Wulandari, Lestari. (2019). Penapisan Bakteri Penghasil Enzim Superoksida Dismurase (SOD) dari Tanah Hutan Mangrove Maron Edupark Semarang. Skripsi. Universitas Setia Budi Surakarta.
Amaliah, Z. Z. N., Bahri, S., & Amelia, P. (2018). Isolasi dan Karakterisasi Bakteri Asam Laktat dari Limbah Cair Rendaman Kacang Kedelai. Jurnal Fitofarmaka Indonesia 5(1): 253-257.
Anggraini, N. E. D., & Setiawan, N. C. E. (2018). Uji Daya Hambat Antibakteri Ekstrak Kasar Enzim Bromelin dari Bonggol Nanas Terhadap Lactobasillus acidhopilus (Ananas comosus (L) Merr) (Doctoral dissertation, Akademi Farmasi Putera Indonesia Malang).
Azhar, F. F., Elvinawati, E., & Nurhamidah, N. (2019). Perbandingan sensitivitas nanopartikel perak dengan Reduktor Albumin dari Telur Ayam dan Bebek untuk Analisis Merkuri. Alotrop, 3(2).
Brahmachari, G., Laskar, S., & Barik, P. (2013). Magnetically Separable MnFe 2 O 4 Nano-Material: An Efficient and Reusable Heterogeneous Catalyst for The Synthesis of 2-Substituted Benzimidazoles and The Extended Synthesis of Quinoxalines at Room Temperature Under Aerobic Conditions. RSC Advances 3(34): 14245-14253.
Fitriya, R. T., Ibrahim, M., & Lisdiana, L. (2015). Keefektifan metode isolasi DNA kit dan CTAB/NaCl yang dimodifikasi pada Staphylococcus aureus dan Shigelladysentriae. LenteraBio, 4(1), 87-92.
Frka‐Petesic, B., Radavidson, H., Jean, B., & Heux, L. (2017). Dynamically Controlled Iridescence of Cholesteric Cellulose Nanocrystal Suspensions Using Electric Fields. Advanced Materials 29(11): 1606208.
Hamidah, M. N., Rianingsih, L., &Romadhon, R. (2019). Aktivitas antibakteri isolat bakteri asam laktat dari peda dengan jenis ikan berbeda terhadap E. coli dan S. aureus. Jurnal Ilmu dan Teknologi Perikanan, 1(2), 11-21.
He, F. (2011). BCA (bicinchoninic acid) protein assay. Bio-protocol, e44-e44.
Indrayati, A., Yurina, V., Pitayu, L. A., & Retnoningrum, D. S. (2011). 16S rDNA-Based Identification of Novel Superoxide Dismutase Producing Bacteria Isolated from Indonesia. Microbiology Indonesia 5(2): 6-6.
Kementerian Kesehatan RI. (2020). Farmakope Indonesia. Edisi VI. Jakarta: Kementerian Kesehatan RI.
Malik, A., Fitri, N., Muna, F., Soebandrio, A., Karuniawati, A., & Sunarno, S. (2014). Metode Cepat Ekstraksi DNA Corynebacterium Diphtheriae untuk Pemeriksaan PCR. Indonesian Bulletin of Health Research 42(2): 20075.
Noer, S. (2021). Identifikasi Bakteri Secara Molekular Menggunakan 16S rRNA. EduBiologia: Biological Science and Education Journal, 1(1), 1-6.
Nofiani, R., Rizky, R., Briliantoro, R., & Ardiningsih, P. (2022). Anti-bacteria and toxicity potential of a rare Actinobacterium Pseudonocardia sp. SM1A, isolated from Mangrove Park, West Kalimantan, Indonesia. Biodiversitas Journal of Biological Diversity, 23(1).
Pananjung, A. M. S., Ulfa, E. U., Senjarini, K., & Arimurti, S. (2016). Karakterisasi isolat bakteri fibrinolitik WU 021055 asal perairan Pantai Papuma, Jember. Jurnal Bioteknologi & Biosains Indonesia (JBBI), 2(1), 1-8.
Qwele, K., Hugo, A., Oyedemi, S. O., Moyo, B., Masika, P. J., & Muchenje, V. (2013). Chemical Composition, Fatty Acid Content and Antioxidant Potential of Meat from Goats Supplemented with Moringa (Moringa oleifera) Leaves, Sunflower Cake and Grass Hay. Meat Science 93(3): 455-462.
Rachmawati, D., Monika, N. L. G. M., & Masruroh, U. (2018). Potensi abu sekam padi untuk meningkatkan ketahanan oksidatif non-enzimatik dan produksi padi merah pada cekaman kekeringan. Jurnal Agronomi Indonesia (Indonesian Journal of Agronomy), 46(1), 24-32.
Safrida, Y. D., Yulvizar, C., & Devira, C. N. (2012). Isolasi dan karakterisasi bakteri berpotensi probiotik pada ikan kembung (Rastrelliger sp.). Depik, 1(3).
Sinaga, M., Nugroho, T. T., & Dahliaty, A. (2014). Pemekatan Enzim Selulase Penicillium sp. LBKURCC20 dengan Pengendapan Amonium Sulfat 80% Jenuh (Doctoral dissertation, Riau University).
Sjafaraenan, S., Lolodatu, H., Johannes, E., Agus, R., & Sabran, A. (2018). Profil DNA Gen Follicle Stimulating Hormone Reseptor (FSHR) pada Wanita Akne dengan Teknik PCR dan Sekuensing DNA. Bioma: Jurnal Biologi Makassar 3(1): 1-11.
Sugiharto. (1994). Dasar-Dasar Pengolahan Air Limbah. Universitas Indonesia. Jakarta.
Weisburg W.G., Barns S.M., Pelletier D.A., & Lane DJ. (1991). 16S Ribosomal DNA Amplification for Phylogenetic Study. Journal of Bacteriol 173(2): 697-703.
Wulandari, Lestari. (2019). Penapisan Bakteri Penghasil Enzim Superoksida Dismurase (SOD) dari Tanah Hutan Mangrove Maron Edupark Semarang. Skripsi. Universitas Setia Budi Surakarta.
Published
2024-01-31
How to Cite
PINESTI, Arum; INDRAYATI, Ana; CAHYO, Lukito Mindi.
Uji Aktivitas SOD (Superoxide Dismutase) Bakteri Limbah Cair Tahu dengan Metode WST-1 (Water Soluble Tetrazolium Salt-1) dan Identifikasi Molekuler Bakteri Menggunakan PCR 16S rDNA.
Jurnal Farmasi Udayana, [S.l.], p. 94-100, jan. 2024.
ISSN 2622-4607.
Available at: <https://ojs.unud.ac.id/index.php/jfu/article/view/96876>. Date accessed: 05 nov. 2024.
doi: https://doi.org/10.24843/JFU.2023.v12.i02.p03.
Section
Articles
