OPTIMASI SUHU ANNEALING DAN AMPLIFIKASI 0,3 kb GEN rpoB DI HULU DARI RRDR PADA ISOLAT P16 Mycobacterium tuberculosis MULTIDRUG RESISTANT DI BALI DENGAN METODE POLYMERASE CHAIN REACTION

  • Putu Lita Astriani Jurusan Farmasi, Fakultas MIPA, Universitas Udayana, Bali-Indonesia
  • Ketut Ratnayani Jurusan Kimia, Fakultas MIPA, Universitas Udayana, Bali-Indonesia
  • Sagung Chandra Yowani 1. Jurusan Farmasi, Fakultas MIPA, Universitas Udayana, Bali-Indonesia 2. Kelompok Studi MDR dan XDR-TB, Fakultas MIPA, Universitas Udayana, Bali-Indonesia

Abstract

ABSTRAK: Mutasi di hulu dari RRDR diindikasikan sebagai adanya low level resistence [1].   Untuk mendapatkan titik mutasi di hulu dari RRDR maka perlu dilakukan amplifikasi fragmen DNA target. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui suhu annealing optimum untuk mengamplifikasi daerah hulu dari RRDR menggunakan  isolat P16 Multidrug Resistant Tuberculosis (MDR-TB) yang didapatkan dari RSUP Sanglah. Proses isolasi DNA dilakukan dengan metode Boom  termodifikasi. Deteksi  produk PCR dilakukan dengan elektroforesis gel agarosa 1,5% b/v dan divisualisasi pada alat UV Transiluminator. Hasil dari penelitian ini diketahui bahwa dengan proses PCR menggunakan sepasang primer FrL2 dan RevL2 dengan suhu annealing optimum 580C dapat mengamplifikasi daerah hulu dari RRDR berukuran 0,3 kb.

 

ABSTRACT: Mutations at the upstream of RRDR indicated as the presence of low level resistance [1].  To find a point mutation at the upstream of RRDR it is necessary to amplify of the target DNA fragment. The aim of this research was to determinate the optimum annealing temperature to amplify the upstream  region of the RRDR using isolate from Sanglah Hospital. Isolation DNA procesed by Boom  modification  method. Product PCR detected using agarosa gel 1,5% b/v and was visualisation by UV Transiluminator. The results of this research, by PCR method using the pairs primer FrL2 and RevL2 with optimum annealing temperature 580C, can amlplify 0,3 kb the upstream region of RRDR.

Downloads

Download data is not yet available.
Published
2014-10-30
How to Cite
ASTRIANI, Putu Lita; RATNAYANI, Ketut; YOWANI, Sagung Chandra. OPTIMASI SUHU ANNEALING DAN AMPLIFIKASI 0,3 kb GEN rpoB DI HULU DARI RRDR PADA ISOLAT P16 Mycobacterium tuberculosis MULTIDRUG RESISTANT DI BALI DENGAN METODE POLYMERASE CHAIN REACTION. CAKRA KIMIA (Indonesian E-Journal of Applied Chemistry), [S.l.], v. 2, n. 2, p. 9 - 13, oct. 2014. ISSN 2302-7274. Available at: <https://ojs.unud.ac.id/index.php/cakra/article/view/10906>. Date accessed: 05 june 2020.
Section
Articles

Keywords

M. tuberculosis; upstream RRDR; annealing temperature; PCR